Stage de Master 2 Validation de sondes fluorescentes pour l'étude des mécanismes de résistance aux lactones macrocycliques anthelminthiques chez Caenorhabditis elegans

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales , implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’UMR1436 INRAE/ENVT INTHERES située sur le site de l’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse. Cette unité de recherche, composée d’une quarantaine d’agents, est dédiée à la recherche sur les innovations thérapeutiques pour la réduction et l’optimisation des usages des antibiotiques et des antiparasitaires.

Les nématodes gastro-intestinaux, notamment Haemonchus contortus , représentent un enjeu sanitaire et économique majeur en élevage. Leur contrôle repose principalement sur l'utilisation des lactones macrocycliques anthelminthiques, telles que l'ivermectine (IVM), l'éprinomectine (EPR) et la moxidectine (MOX). Cependant, l'utilisation intensive et non raisonnée de ces molécules a conduit à l'émergence de résistances, compromettant l'efficacité des traitements. Les méthodes actuelles de détection, comme le test de réduction d'excrétion fécale des œufs (FECRT), restent longues à mettre en œuvre et peu sensibles aux résistances émergentes. Le développement d'outils diagnostiques plus rapides et plus sensibles constitue donc un enjeu majeur pour une gestion durable de ces résistances.

Dans ce contexte, notre équipe a développé des sondes fluorescentes dérivées de l'IVM, de l'EPR et de la MOX (IVM-F, EPR-F et MOX-F), permettant d'étudier la distribution de ces molécules chez les nématodes et d'explorer les mécanismes de résistance associés. Le présent projet de Master 2 s'inscrit dans cette dynamique et vise à poursuivre la validation biologique de ces nouvelles sondes fluorescentes.

L'objectif du projet de Master 2 sera d'évaluer si les sondes fluorescentes dérivées des lactones macrocycliques anthelminthiques (IVM-F, EPR-F et MOX-F) reproduisent les profils de sensibilité observés avec les molécules natives et permettent de mettre en évidence les phénomènes de résistance. Pour cela, des Larval Development Assays (LDA) sur milieu solide seront réalisés sur une souche sensible de Caenorhabditis elegans et cinq souches résistantes : trois souches résistantes à l'IVM (IVR10 Canada, IVR10 2014 et IVR10 2022), une souche résistante à la MOX (MOXR) et une souche résistante à l'EPR(EPRR). L'étude visera également à évaluer les phénomènes de résistance croisée entre les différentes lactones macrocycliques fluorescentes.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• Réaliser des Larval Development Assays (LDA) sur milieu solide avec les sondes fluorescentes dérivées des lactones macrocycliques anthelminthiques (IVM-F, EPR-F et MOX-F) sur une souche sensible et cinq souches résistantes de Caenorhabditis elegans (IVR10 Canada, IVR10 2014, IVR10 2022, MOXR et EPRR).
• Déterminer les CI₅₀, les facteurs de résistance et comparer les profils de sensibilité des différentes souches étudiées.
• Étudier les phénomènes de résistance croisée entre les dérivés fluorescents des lactones macrocycliques anthelminthiques.
• Exploiter, analyser et interpréter les résultats obtenus afin de contribuer à la validation des sondes fluorescentes comme outils d'étude des mécanismes de résistance aux lactones macrocycliques.

Conditions particulières d’activité :

- Culture et maintenance du nématode Caenorhabditis elegans .

- Réalisation de tests biologiques en laboratoire (Larval Development Assays).

- Analyse et traitement statistique de données expérimentales

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Formation recommandée : Master 2 (ou dernière année d'école d'ingénieur) en biologie, microbiologie, parasitologie ou pharmacologie.

Connaissances souhaitées :

• Connaissances en biologie, parasitologie ou microbiologie.
• Notions en pharmacologie ou toxicologie.
• Bases en expérimentation biologique.
• Connaissances des techniques de travail en conditions stériles (ou intérêt pour leur apprentissage).
• Maîtrise des outils bureautiques (Excel, Word, PPT).
• Connaissances en analyses statistiques (R, GraphPad Prism) seraient appréciées.
• Connaissance des bonnes pratiques de laboratoire et des règles d'hygiène et de sécurité.
• Motivation pour la recherche, rigueur, curiosité scientifique, dynamisme, aptitude au travail en équipe, adaptabilité, autonomie

Goût pour la recherche bibliographique ; bon niveau d'anglais scientifique (lecture d'articles)

Modalités pour postuler

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr