Ingénieur d'étude hospitalier (H/F)

À propos de nous Au cœur de la région Occitanie Ouest et d'une agglomération au taux de croissance démographique soutenu, l e Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Toulouse est la structure sanitaire de référence sur son territoire, reconnu au niveau national comme le 1er établissement public hospitalier de France ( dernier palmarès du journal Le Point ). Constitué de plusieurs sites répartis au nord et au sud de la ville, le CHU de Toulouse est un des premiers employeurs de la région, accomplissant ses missions de soins, de prévention, d'enseignement et de recherche grâce à près de 4 000 médecins et 12 000 personnels hospitaliers (soit près de 16 000 personnes au service de la santé). Il prend en charge environ 280 000 patients et réalise 900 000 consultations externes chaque année, ce qui le situe au quatrième rang des hôpitaux français en matière d'activité. Le CHU de Toulouse offre une grande diversité de métiers au sein de ses 14 pôles médicaux, 5 pôles médico-techniques et de ses directions supports, qui regroupent l'administration générale, les ressources matérielles et la recherche. Nous recrutons un(e) Ingénieur de recherche hospitalier (ingénieur d'étude) sur le site de l'Oncopole en CDD de 6 mois à temps complet. Mission Nous avons besoin d'un ingénieur de recherche afin d'analyse des données de single cell RNAseq/single nuclei RNAseq et de transcriptomique pour étudier l'hétérogénité tumorale de l'ostéosarcome (OS), une tumeur osseuse maligne rare. Votre mission ira de l'étape d'alignement des données jusqu'à l'identification cellulaire en collaboration avec l'équipe d'anatomopathologiste du CHU de Toulouse. Activités génériques du métier

• Développer, tester et implémenter des pipelines d'analyse bio-informatique
• Effectuer des analyses computationnelles et statistiques en transcriptomique
• Mettre en forme les résultats en vue de publications et assurer la pérennité des outils et résultats à travers des outils de gestion de projet et de documentation adaptés
• Diffuser et valoriser les résultats et réalisations sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales, y compris en Anglais

Profil Prérequis obligatoires :

• Diplôme de type Bac +5 dans le domaine de la bio-informatique.
• Maîtrise du travail sous linux en ligne de commande (bash)
• Maîtrise d'au moins un langage de script (ex. Python, R ou bash)
• Expérience en gestion de projet et documentation
• Exprérience en analyse transcriptomique

Rejoindre le CHU de Toulouse c'est bénéficier :

• Un environnement de travail éco responsable et de qualité avec des facilités d'accès (crèches, transport en commun, parking).
• Une prise en charge de 75% des frais des abonnements Tisséo, Sncf et VélÔToulouse.
• Un CE/CGOS : prestations sociales, aides remboursables logement, CESU, chèques vacances, voyages, chèques culture.
• Un restaurant pour le personnel et des repas à emporter au tarif unique de 4,15 €

Intégrer le CHU de Toulouse, c'est participer au quotidien à une offre de soins d'excellence et de proximité en réponse aux besoins de la population.